В основу Дарвиновского музея, первоначально созданного в 1907 году как учебный музей при "Московских высших женских курсах", легли экспонаты, собранные и изготовленные его основателем, доктором биологических наук Александром Федоровичем Котсем.
В 1922 году музей получил собственное помещение и государственную поддержку, а ученый-коллекционер стал его первым директором.
Сейчас крупнейшая в Европе коллекция Государственного Дарвиновского музея насчитывает более двух десятков тысяч экспонатов. Многие из которых эксклюзивные. Коллекция постоянно пополняется, а экспозиция меняется каждый год.